Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CWC25Q9NXE8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CWC25Q9NXE8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CWC25Q9NXE8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CWC25Q9NXE8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CWC25Q9NXE8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CWC25Q9NXE8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CWC25Q9NXE8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CWC25Q9NXE8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CWC25Q9NXE8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CWC25Q9NXE8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CWC25Q9NXE8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CWC25Q9NXE8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CWC25Q9NXE8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CWC25Q9NXE8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CWC25Q9NXE8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CWC25Q9NXE8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CWC25Q9NXE8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CWC25Q9NXE8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CWC25Q9NXE8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CWC25Q9NXE8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CWC25Q9NXE8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CWC25Q9NXE8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CWC25Q9NXE8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CWC25Q9NXE8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CWC25Q9NXE8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CWC25Q9NXE8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CWC25Q9NXE8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CWC25Q9NXE8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CWC25Q9NXE8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CWC25Q9NXE8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CWC25Q9NXE8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CWC25Q9NXE8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CWC25Q9NXE8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CWC25Q9NXE8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CWC25Q9NXE8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CWC25Q9NXE8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CWC25Q9NXE8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CWC25Q9NXE8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CWC25Q9NXE8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CWC25Q9NXE8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CWC25Q9NXE8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CWC25Q9NXE8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CWC25Q9NXE8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CWC25Q9NXE8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CWC25Q9NXE8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CWC25Q9NXE8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms