Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHCHD3Q9NX63 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHCHD3Q9NX63 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD3Q9NX63 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD3Q9NX63 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD3Q9NX63 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD3Q9NX63 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD3Q9NX63 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHCHD3Q9NX63 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHCHD3Q9NX63 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHCHD3Q9NX63 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHCHD3Q9NX63 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHCHD3Q9NX63 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHCHD3Q9NX63 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHCHD3Q9NX63 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD3Q9NX63 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD3Q9NX63 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD3Q9NX63 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD3Q9NX63 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHCHD3Q9NX63 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHCHD3Q9NX63 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHCHD3Q9NX63 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms