Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL2Q9NX52 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL2Q9NX52 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL2Q9NX52 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL2Q9NX52 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHBDL2Q9NX52 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHBDL2Q9NX52 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL2Q9NX52 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDL2Q9NX52 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL2Q9NX52 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL2Q9NX52 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL2Q9NX52 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL2Q9NX52 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL2Q9NX52 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL2Q9NX52 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDL2Q9NX52 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDL2Q9NX52 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDL2Q9NX52 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms