Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.097e-7■■■■■ 30.7
SLTMQ9NWH9 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.027e-7■■■■■ 30.7
SLTMQ9NWH9 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 30.7
SLTMQ9NWH9 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.953e-6■■■■■ 30.5
SLTMQ9NWH9 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 30.5
SLTMQ9NWH9 TNRC6A-207ENST00000491718 7956 ntTSL 1 (best)7.31□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 30.5
SLTMQ9NWH9 PRKCZ-201ENST00000378567 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)23.99■■□□□ 1.439e-7■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.564e-7■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.284e-7■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.154e-7■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 TMEM44-207ENST00000430601 682 ntTSL 321.39■■□□□ 1.014e-7■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.994e-7■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 TMEM44-205ENST00000419280 1212 ntTSL 517.64■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 TMEM44-214ENST00000494894 859 ntTSL 316.19■□□□□ 0.184e-7■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 PKNOX1-202ENST00000418336 459 ntTSL 221.37■■□□□ 1.015e-8■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 PKNOX1-206ENST00000480179 1725 ntTSL 215.38■□□□□ 0.055e-8■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 PKNOX1-201ENST00000291547 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.395e-8■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 PKNOX1-203ENST00000432907 5180 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.465e-8■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 CBX4-203ENST00000494546 432 ntTSL 334.43■■■■□ 3.13e-8■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.333e-8■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.273e-8■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 RAB1A-205ENST00000494188 771 ntTSL 223.84■■□□□ 1.412e-8■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.893e-8■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 SEPT9-223ENST00000589140 552 ntTSL 420.35■□□□□ 0.852e-8■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.83e-8■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.213e-8■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 SCAMP4-212ENST00000590266 570 ntTSL 514.56□□□□□ -0.083e-8■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.173e-8■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 LINC01134-203ENST00000442673 3059 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.223e-8■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 PTBP1-211ENST00000587094 273 ntTSL 311.88□□□□□ -0.513e-8■■■■■ 30.4
SLTMQ9NWH9 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 30.2
SLTMQ9NWH9 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.95□□□□□ -1.782e-10■■■■■ 30.2
SLTMQ9NWH9 MICALL2-202ENST00000413446 3046 ntTSL 214.45□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 30.2
SLTMQ9NWH9 ANKRD23-205ENST00000476975 1132 ntTSL 513.99□□□□□ -0.175e-7■■■■■ 30.1
SLTMQ9NWH9 PCSK6-210ENST00000559499 3325 ntTSL 216.2■□□□□ 0.188e-8■■■■■ 30.1
SLTMQ9NWH9 PCSK6-209ENST00000559430 338 ntTSL 313.79□□□□□ -0.28e-8■■■■■ 30.1
SLTMQ9NWH9 ZBED1-204ENST00000461691 947 ntTSL 214.47□□□□□ -0.094e-8■■■■■ 30
SLTMQ9NWH9 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 30
SLTMQ9NWH9 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 30
SLTMQ9NWH9 CAMSAP1-201ENST00000312405 6054 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.371e-8■■■■■ 30
SLTMQ9NWH9 CAMSAP1-209ENST00000492174 612 ntTSL 57.41□□□□□ -1.221e-8■■■■■ 30
SLTMQ9NWH9 MCM3AP-AS1-208ENST00000590829 703 ntTSL 417.27■□□□□ 0.367e-7■■■■■ 30
SLTMQ9NWH9 EGFL7-207ENST00000492862 723 ntTSL 518.57■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 29.8
SLTMQ9NWH9 LPCAT1-202ENST00000475622 5610 ntTSL 520.49■□□□□ 0.873e-7■■■■■ 29.8
SLTMQ9NWH9 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 29.8
SLTMQ9NWH9 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 512.27□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 29.8
SLTMQ9NWH9 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.489e-7■■■■■ 29.8
SLTMQ9NWH9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.362e-6■■■■■ 29.6
SLTMQ9NWH9 SLC25A42-204ENST00000597661 519 ntTSL 316.6■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 29.6
SLTMQ9NWH9 SLC25A42-202ENST00000594070 1228 ntTSL 213.11□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 29.6
SLTMQ9NWH9 TPST1-205ENST00000490159 248 ntTSL 56.98□□□□□ -1.291e-6■■■■■ 29.6
SLTMQ9NWH9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.023e-7■■■■■ 29.6
SLTMQ9NWH9 DNAAF5-204ENST00000438961 579 ntTSL 420.63■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 29.4
SLTMQ9NWH9 BOD1L1-201ENST00000040738 10565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 29.3
SLTMQ9NWH9 PDXK-212ENST00000470029 583 ntTSL 320.27■□□□□ 0.846e-7■■■■■ 29.3
SLTMQ9NWH9 EGFL7-205ENST00000490469 456 ntTSL 517.77■□□□□ 0.442e-8■■■■■ 29.3
SLTMQ9NWH9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 29.3
SLTMQ9NWH9 CMIP-206ENST00000565029 1559 ntTSL 1 (best)15.51■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 29.3
SLTMQ9NWH9 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 29.3
SLTMQ9NWH9 STK11-203ENST00000585748 746 ntTSL 314.2□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 29.3
SLTMQ9NWH9 LRRC37A3-211ENST00000584306 5665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 LRRC37A3-201ENST00000319651 5537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 LRRC37A3-209ENST00000581368 735 ntAPPRIS ALT2 TSL 36.06□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.777e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.67e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.467e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.467e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 BANP-209ENST00000439677 736 ntTSL 517.39■□□□□ 0.377e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.377e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.377e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.157e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 PFKL-208ENST00000491298 819 ntTSL 514.82□□□□□ -0.047e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 BANP-219ENST00000485772 608 ntTSL 513.45□□□□□ -0.267e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 FBXO11-209ENST00000492225 2216 ntTSL 1 (best)13.17□□□□□ -0.37e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 BANP-206ENST00000423252 644 ntTSL 512.54□□□□□ -0.47e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 BANP-220ENST00000488074 759 ntTSL 312.48□□□□□ -0.417e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 BANP-222ENST00000526460 547 ntTSL 411.25□□□□□ -0.617e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 BANP-212ENST00000459966 627 ntTSL 29.49□□□□□ -0.897e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.917e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 BANP-210ENST00000454563 558 ntTSL 48.59□□□□□ -1.037e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 BANP-213ENST00000466197 640 ntTSL 58.2□□□□□ -1.17e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 BANP-225ENST00000569400 802 ntTSL 47.88□□□□□ -1.157e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 BANP-205ENST00000412691 586 ntTSL 47.88□□□□□ -1.157e-8■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.379e-7■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.159e-7■■■■■ 29.2
SLTMQ9NWH9 GPX4-202ENST00000585362 859 ntTSL 227.22■■□□□ 1.951e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.281e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 SH3D21-201ENST00000453908 2408 ntAPPRIS P1 TSL 522.77■■□□□ 1.241e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.091e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.071e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.051e-6■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 GPX4-209ENST00000593032 583 ntTSL 319.19■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 SCARB1-205ENST00000538291 5527 ntTSL 519.1■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 29.1
SLTMQ9NWH9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 29.1
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