RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378567.7

PRKCZ-201, Transcript of protein kinase C zeta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best)

Gene PRKCZ, Length 2,326 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZ-201ENST00000378567 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.87■■■■■ 5.41
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PRKCZ-201ENST00000378567 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.8■■■■■ 4.12
PRKCZ-201ENST00000378567 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.36■■■■■ 4.05
PRKCZ-201ENST00000378567 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.23■■■■■ 4.03
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PRKCZ-201ENST00000378567 ABCC9O60706 1549 aa39.33■■■■□ 3.89
PRKCZ-201ENST00000378567 SCRIBQ14160 1630 aa39.1■■■■□ 3.85
PRKCZ-201ENST00000378567 NACADO15069 1562 aa39■■■■□ 3.83
PRKCZ-201ENST00000378567 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.51■■■■□ 3.76
PRKCZ-201ENST00000378567 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
PRKCZ-201ENST00000378567 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.27■■■■□ 3.72
PRKCZ-201ENST00000378567 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.06■■■■□ 3.68
PRKCZ-201ENST00000378567 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.93■■■■□ 3.66
PRKCZ-201ENST00000378567 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.89■■■■□ 3.66
PRKCZ-201ENST00000378567 WIZO95785 1651 aa37.67■■■■□ 3.62
PRKCZ-201ENST00000378567 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.62■■■■□ 3.61
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PRKCZ-201ENST00000378567 SMARCA4P51532 1647 aa37.41■■■■□ 3.58
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PRKCZ-201ENST00000378567 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
PRKCZ-201ENST00000378567 TRIM41Q8WV44 630 aa37.06■■■■□ 3.52
PRKCZ-201ENST00000378567 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.99■■■■□ 3.51
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PRKCZ-201ENST00000378567 SMARCA2P51531 1590 aa36.9■■■■□ 3.5
PRKCZ-201ENST00000378567 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.87■■■■□ 3.49
PRKCZ-201ENST00000378567 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.8■■■■□ 3.48
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PRKCZ-201ENST00000378567 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.57■■■■□ 3.45
PRKCZ-201ENST00000378567 ABCC8Q09428 1581 aa36.5■■■■□ 3.43
PRKCZ-201ENST00000378567 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
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PRKCZ-201ENST00000378567 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.18■■■■□ 3.38
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PRKCZ-201ENST00000378567 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.01■■■■□ 3.36
PRKCZ-201ENST00000378567 SOGA1O94964 1423 aa35.96■■■■□ 3.35
PRKCZ-201ENST00000378567 SYNJ1O43426 1573 aa35.91■■■■□ 3.34
PRKCZ-201ENST00000378567 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.82■■■■□ 3.32
PRKCZ-201ENST00000378567 EEA1Q15075 1411 aa35.8■■■■□ 3.32
PRKCZ-201ENST00000378567 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
PRKCZ-201ENST00000378567 HRCP23327 699 aa35.74■■■■□ 3.31
PRKCZ-201ENST00000378567 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.67■■■■□ 3.3
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PRKCZ-201ENST00000378567 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.52■■■■□ 3.28
PRKCZ-201ENST00000378567 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.52■■■■□ 3.28
PRKCZ-201ENST00000378567 CFTRP13569 1480 aa35.51■■■■□ 3.28
PRKCZ-201ENST00000378567 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.5■■■■□ 3.27
PRKCZ-201ENST00000378567 CEP162Q5TB80 1403 aa35.47■■■■□ 3.27
PRKCZ-201ENST00000378567 GOLGA3Q08378 1498 aa35.47■■■■□ 3.27
PRKCZ-201ENST00000378567 KIF21BO75037 1637 aa35.39■■■■□ 3.26
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PRKCZ-201ENST00000378567 CUX1P39880 1505 aa35.36■■■■□ 3.25
PRKCZ-201ENST00000378567 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.36■■■■□ 3.25
PRKCZ-201ENST00000378567 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
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PRKCZ-201ENST00000378567 CLIP1P30622 1438 aa34.98■■■■□ 3.19
PRKCZ-201ENST00000378567 KIF27Q86VH2 1401 aa34.97■■■■□ 3.19
PRKCZ-201ENST00000378567 PRXQ9BXM0 1461 aa34.97■■■■□ 3.19
PRKCZ-201ENST00000378567 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.95■■■■□ 3.19
PRKCZ-201ENST00000378567 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.89■■■■□ 3.18
PRKCZ-201ENST00000378567 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
PRKCZ-201ENST00000378567 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.83■■■■□ 3.17
PRKCZ-201ENST00000378567 NESP48681 1621 aa34.83■■■■□ 3.17
PRKCZ-201ENST00000378567 CUX2O14529 1486 aa34.78■■■■□ 3.16
PRKCZ-201ENST00000378567 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.76■■■■□ 3.16
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PRKCZ-201ENST00000378567 ARAP1Q96P48 1450 aa34.56■■■■□ 3.12
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PRKCZ-201ENST00000378567 CUL7Q14999 1698 aa34.2■■■■□ 3.07
PRKCZ-201ENST00000378567 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.14■■■■□ 3.06
PRKCZ-201ENST00000378567 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
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PRKCZ-201ENST00000378567 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.03■■■■□ 3.04
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PRKCZ-201ENST00000378567 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.94■■■■□ 3.02
PRKCZ-201ENST00000378567 TIAM1Q13009 1591 aa33.92■■■■□ 3.02
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