Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATAD3AQ9NVI7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD3AQ9NVI7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATAD3AQ9NVI7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATAD3AQ9NVI7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms