Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACER3Q9NUN7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACER3Q9NUN7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACER3Q9NUN7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACER3Q9NUN7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms