Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL3

STAU2, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAU2Q9NUL3 SEPT9-219ENST00000588575 559 ntTSL 420.73■□□□□ 0.913e-6■■□□□ 13.5
STAU2Q9NUL3 MICALL2-204ENST00000467394 2080 ntTSL 221■□□□□ 0.958e-8■■□□□ 13.5
STAU2Q9NUL3 MICALL2-209ENST00000479007 1855 ntTSL 220.52■□□□□ 0.888e-8■■□□□ 13.5
STAU2Q9NUL3 MICALL2-211ENST00000487156 874 ntTSL 519.41■□□□□ 0.78e-8■■□□□ 13.5
STAU2Q9NUL3 MICALL2-208ENST00000472100 5248 ntTSL 218.48■□□□□ 0.558e-8■■□□□ 13.5
STAU2Q9NUL3 MICALL2-215ENST00000496184 2722 ntTSL 218.22■□□□□ 0.518e-8■■□□□ 13.5
STAU2Q9NUL3 MICALL2-205ENST00000467783 639 ntTSL 318.17■□□□□ 0.58e-8■■□□□ 13.5
STAU2Q9NUL3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.368e-8■■□□□ 13.5
STAU2Q9NUL3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.328e-8■■□□□ 13.5
STAU2Q9NUL3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.288e-8■■□□□ 13.5
STAU2Q9NUL3 GPX3-206ENST00000521632 1314 ntTSL 515.45■□□□□ 0.068e-8■■□□□ 13.5
STAU2Q9NUL3 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 08e-8■■□□□ 13.5
STAU2Q9NUL3 MICALL2-202ENST00000413446 3046 ntTSL 214.13□□□□□ -0.158e-8■■□□□ 13.5
STAU2Q9NUL3 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.043e-6■■□□□ 13.4
STAU2Q9NUL3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.814e-7■■□□□ 13.4
STAU2Q9NUL3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.514e-7■■□□□ 13.4
STAU2Q9NUL3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.954e-7■■□□□ 13.4
STAU2Q9NUL3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.614e-7■■□□□ 13.4
STAU2Q9NUL3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.294e-7■■□□□ 13.4
STAU2Q9NUL3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.154e-7■■□□□ 13.4
STAU2Q9NUL3 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.153e-6■■□□□ 13.3
STAU2Q9NUL3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.451e-6■■□□□ 13.3
STAU2Q9NUL3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.881e-6■■□□□ 13.3
STAU2Q9NUL3 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 516■□□□□ 0.151e-6■■□□□ 13.3
STAU2Q9NUL3 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.071e-6■■□□□ 13.3
STAU2Q9NUL3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.073e-6■■□□□ 13.3
STAU2Q9NUL3 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.373e-6■■□□□ 13.3
STAU2Q9NUL3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.236e-7■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 CLN6-224ENST00000638076 2323 ntTSL 1 (best)22.53■■□□□ 1.26e-7■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 AC107871.1-203ENST00000637054 3238 ntTSL 517.98■□□□□ 0.476e-7■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 AC107871.1-201ENST00000637888 2941 ntTSL 517.54■□□□□ 0.46e-7■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.366e-7■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 CLN6-217ENST00000636964 3335 ntTSL 211.97□□□□□ -0.496e-7■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 AC107871.1-204ENST00000638026 2895 ntTSL 1 (best)11.84□□□□□ -0.516e-7■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 ANKRD11-210ENST00000566858 580 ntTSL 415.96■□□□□ 0.152e-6■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 215.76■□□□□ 0.112e-6■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 ANKRD11-212ENST00000567699 412 ntTSL 515.33■□□□□ 0.042e-6■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 514.56□□□□□ -0.082e-6■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.112e-6■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 414.34□□□□□ -0.112e-6■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 314.15□□□□□ -0.142e-6■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 513.99□□□□□ -0.172e-6■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 LRP1-211ENST00000556356 5114 ntTSL 215.98■□□□□ 0.154e-16■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.934e-16■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 SHANK2-215ENST00000470759 762 ntTSL 519.25■□□□□ 0.676e-6■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 SHANK2-214ENST00000468619 2775 ntTSL 213.61□□□□□ -0.236e-6■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 SHANK2-217ENST00000498519 510 ntTSL 313.54□□□□□ -0.246e-6■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.252e-6■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 ANAPC7-204ENST00000464697 734 ntTSL 311.86□□□□□ -0.512e-6■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 ANAPC7-201ENST00000450008 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.522e-6■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 ANAPC7-212ENST00000552170 579 ntTSL 410.42□□□□□ -0.742e-6■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.542e-6■■□□□ 13.2
STAU2Q9NUL3 IGF2BP1-202ENST00000431824 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.442e-38■■□□□ 13.1
STAU2Q9NUL3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.152e-6■■□□□ 13.1
STAU2Q9NUL3 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 222.1■■□□□ 1.132e-6■■□□□ 13.1
STAU2Q9NUL3 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-6■■□□□ 13.1
STAU2Q9NUL3 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.232e-6■■□□□ 13.1
STAU2Q9NUL3 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 411.21□□□□□ -0.612e-6■■□□□ 13.1
STAU2Q9NUL3 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 29.43□□□□□ -0.92e-6■■□□□ 13
STAU2Q9NUL3 NKD1-202ENST00000564336 477 ntTSL 322.78■■□□□ 1.245e-7■■□□□ 12.9
STAU2Q9NUL3 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.835e-7■■□□□ 12.9
STAU2Q9NUL3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.892e-6■■□□□ 12.9
STAU2Q9NUL3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.782e-6■■□□□ 12.9
STAU2Q9NUL3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.482e-6■■□□□ 12.9
STAU2Q9NUL3 ASGR1-207ENST00000574330 887 ntTSL 516.45■□□□□ 0.222e-6■■□□□ 12.9
STAU2Q9NUL3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-6■■□□□ 12.9
STAU2Q9NUL3 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.162e-6■■□□□ 12.9
STAU2Q9NUL3 ASGR1-203ENST00000570576 627 ntTSL 513.85□□□□□ -0.192e-6■■□□□ 12.9
STAU2Q9NUL3 PIGT-235ENST00000638967 2194 ntTSL 58.24□□□□□ -1.095e-11■■□□□ 12.9
STAU2Q9NUL3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.571e-6■■□□□ 12.8
STAU2Q9NUL3 SPC24-207ENST00000592967 833 ntTSL 316.71■□□□□ 0.271e-6■■□□□ 12.8
STAU2Q9NUL3 SPC24-203ENST00000585567 633 ntTSL 315.67■□□□□ 0.11e-6■■□□□ 12.8
STAU2Q9NUL3 SPC24-205ENST00000591396 832 ntTSL 515.04■□□□□ -01e-6■■□□□ 12.8
STAU2Q9NUL3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.122e-6■■□□□ 12.8
STAU2Q9NUL3 FOXK2-204ENST00000527313 779 ntTSL 320.72■□□□□ 0.912e-6■■□□□ 12.8
STAU2Q9NUL3 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)20.66■□□□□ 0.92e-6■■□□□ 12.8
STAU2Q9NUL3 FOXK2-207ENST00000570585 756 ntTSL 313.71□□□□□ -0.212e-6■■□□□ 12.8
STAU2Q9NUL3 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 220.1■□□□□ 0.813e-6■■□□□ 12.8
STAU2Q9NUL3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.024e-8■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.325e-7■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 SLC39A14-209ENST00000520644 377 ntTSL 520.16■□□□□ 0.825e-7■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 SLC39A14-212ENST00000524285 570 ntTSL 417.85■□□□□ 0.455e-7■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.135e-7■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.345e-7■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.425e-7■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 FGFR4-216ENST00000514472 552 ntTSL 422.28■■□□□ 1.161e-8■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 FGFR4-214ENST00000513166 594 ntTSL 421.89■■□□□ 1.091e-8■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 FGFR4-212ENST00000510911 709 ntTSL 421.27■■□□□ 11e-8■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 FGFR4-209ENST00000507708 476 ntTSL 321.18■□□□□ 0.981e-8■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 FGFR4-204ENST00000426612 712 ntTSL 1 (best)21.04■□□□□ 0.961e-8■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 FGFR4-211ENST00000509511 1341 ntTSL 1 (best)20.16■□□□□ 0.821e-8■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 FGFR4-208ENST00000503708 770 ntTSL 418.7■□□□□ 0.581e-8■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.571e-8■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.521e-8■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.491e-8■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 FGFR4-205ENST00000430285 713 ntTSL 1 (best)17.14■□□□□ 0.331e-8■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.331e-8■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 CAPN15-208ENST00000637507 1482 ntTSL 522.54■■□□□ 1.24e-6■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.288e-7■■□□□ 12.7
STAU2Q9NUL3 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.428e-7■■□□□ 12.7
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