Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FARSBQ9NSD9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FARSBQ9NSD9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FARSBQ9NSD9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FARSBQ9NSD9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FARSBQ9NSD9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FARSBQ9NSD9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FARSBQ9NSD9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FARSBQ9NSD9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FARSBQ9NSD9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FARSBQ9NSD9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FARSBQ9NSD9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARSBQ9NSD9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARSBQ9NSD9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARSBQ9NSD9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARSBQ9NSD9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FARSBQ9NSD9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FARSBQ9NSD9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARSBQ9NSD9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FARSBQ9NSD9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms