Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT82Q9NSB4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT82Q9NSB4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT82Q9NSB4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT82Q9NSB4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT82Q9NSB4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT82Q9NSB4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT82Q9NSB4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT82Q9NSB4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT82Q9NSB4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT82Q9NSB4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT82Q9NSB4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT82Q9NSB4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT82Q9NSB4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT82Q9NSB4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT82Q9NSB4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT82Q9NSB4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT82Q9NSB4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT82Q9NSB4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT82Q9NSB4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT82Q9NSB4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms