Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY6

PLSCR3, Phospholipid scramblase 3, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLSCR3Q9NRY6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLSCR3Q9NRY6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLSCR3Q9NRY6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLSCR3Q9NRY6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLSCR3Q9NRY6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLSCR3Q9NRY6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLSCR3Q9NRY6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PLSCR3Q9NRY6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLSCR3Q9NRY6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLSCR3Q9NRY6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms