Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 NEK6-201ENST00000320246 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 601.6
UTP3Q9NQZ2 NEK6-208ENST00000425237 806 ntTSL 312.29□□□□□ -0.444e-7■■■■■ 601.6
UTP3Q9NQZ2 NEK6-204ENST00000373603 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.774e-7■■■■■ 601.6
UTP3Q9NQZ2 MXRA8-204ENST00000460473 339 ntTSL 226.92■■□□□ 1.98e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 SMOX-208ENST00000484515 900 ntTSL 326.16■■□□□ 1.788e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.688e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.628e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.618e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 RHBDF1-208ENST00000482904 556 ntTSL 325.06■■□□□ 1.68e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.428e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.368e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 CC2D1A-202ENST00000585896 1843 ntTSL 221.45■■□□□ 1.038e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 MXRA8-205ENST00000464351 405 ntTSL 221.11■□□□□ 0.978e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.978e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.948e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.928e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.828e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 CYP2E1-208ENST00000480558 753 ntTSL 219.92■□□□□ 0.788e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 TBC1D31-208ENST00000519418 569 ntTSL 319.57■□□□□ 0.728e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.728e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.688e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 DUS3L-208ENST00000590110 977 ntTSL 219.01■□□□□ 0.638e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.618e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.68e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.588e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.578e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.568e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.558e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.518e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.498e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.468e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 SH2D2A-205ENST00000486350 781 ntTSL 317.66■□□□□ 0.428e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 SH2D2A-204ENST00000468744 699 ntTSL 217.07■□□□□ 0.328e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 KDM8-206ENST00000563881 260 ntTSL 216.93■□□□□ 0.38e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.268e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 EXOSC4-203ENST00000527954 1065 ntTSL 216.12■□□□□ 0.178e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 DUS3L-204ENST00000589085 2301 ntTSL 516.06■□□□□ 0.168e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -08e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.038e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 SH2D2A-203ENST00000392306 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.138e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 TBC1D31-201ENST00000287380 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.188e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 MXI1-206ENST00000442296 634 ntTSL 513.31□□□□□ -0.288e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 CCDC142-206ENST00000473278 810 ntTSL 213.08□□□□□ -0.328e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 CYP2E1-207ENST00000477500 625 ntTSL 312.92□□□□□ -0.348e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 CCDC102B-211ENST00000584775 1179 ntTSL 1 (best)11.8□□□□□ -0.528e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 SMOX-210ENST00000493223 280 ntTSL 311.71□□□□□ -0.538e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 CCDC102B-207ENST00000581520 465 ntTSL 311.6□□□□□ -0.558e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 CCDC102B-209ENST00000582371 541 ntTSL 310.9□□□□□ -0.668e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 CYP2E1-204ENST00000421586 1068 ntTSL 1 (best)10.13□□□□□ -0.798e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 CYP2E1-203ENST00000418356 918 ntTSL 1 (best)9.73□□□□□ -0.858e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 TBC1D31-202ENST00000327098 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.858e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 CCDC142-208ENST00000486335 566 ntTSL 59.59□□□□□ -0.878e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 TBC1D31-204ENST00000518577 864 ntTSL 59.39□□□□□ -0.918e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 LINC01572-202ENST00000563770 568 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.938e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 CCDC102B-204ENST00000578970 537 ntTSL 49.19□□□□□ -0.948e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 CYP2E1-209ENST00000541080 745 ntTSL 1 (best)8.44□□□□□ -1.068e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.698e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.768e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.788e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.868e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 TBC1D31-215ENST00000524307 3101 ntTSL 22.37□□□□□ -2.038e-25■■■■■ 596.2
UTP3Q9NQZ2 SUGP2-205ENST00000594445 732 ntTSL 326.92■■□□□ 1.91e-8■■■■■ 592.6
UTP3Q9NQZ2 SUGP2-210ENST00000598202 764 ntTSL 412.88□□□□□ -0.351e-8■■■■■ 592.6
UTP3Q9NQZ2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.558e-14■■■■■ 588.5
UTP3Q9NQZ2 ZNHIT1-203ENST00000485387 2898 ntTSL 1 (best)14.61□□□□□ -0.078e-14■■■■■ 588.5
UTP3Q9NQZ2 ZNHIT1-204ENST00000492315 3958 ntTSL 210.79□□□□□ -0.688e-14■■■■■ 588.5
UTP3Q9NQZ2 ZNHIT1-202ENST00000461205 571 ntTSL 310.57□□□□□ -0.728e-14■■■■■ 588.5
UTP3Q9NQZ2 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.081e-9■■■■■ 587.9
UTP3Q9NQZ2 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.061e-9■■■■■ 587.9
UTP3Q9NQZ2 PAXIP1-203ENST00000419436 521 ntTSL 46.56□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 587.8
UTP3Q9NQZ2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.458e-29■■■■■ 586.9
UTP3Q9NQZ2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.998e-29■■■■■ 586.9
UTP3Q9NQZ2 PFKFB3-209ENST00000461744 2098 ntTSL 519.07■□□□□ 0.648e-29■■■■■ 586.9
UTP3Q9NQZ2 STARD9-202ENST00000562139 656 ntTSL 418.35■□□□□ 0.538e-32■■■■■ 586.9
UTP3Q9NQZ2 STARD9-207ENST00000569419 666 ntTSL 518.35■□□□□ 0.538e-32■■■■■ 586.9
UTP3Q9NQZ2 AARS2-202ENST00000491573 735 ntTSL 213.98□□□□□ -0.178e-32■■■■■ 586.9
UTP3Q9NQZ2 MLXIPL-207ENST00000453275 690 ntTSL 520.85■□□□□ 0.936e-28■■■■■ 583.8
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-217ENST00000530005 1434 ntTSL 1 (best)20.62■□□□□ 0.895e-7■■■■■ 582.4
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-211ENST00000529112 653 ntTSL 515.49■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 582.4
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.025e-7■■■■■ 582.4
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-216ENST00000529896 494 ntTSL 414.29□□□□□ -0.125e-7■■■■■ 582.4
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-202ENST00000395123 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.355e-7■■■■■ 582.4
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-221ENST00000566946 2162 ntTSL 1 (best)22.12■■□□□ 1.134e-47■■■■■ 577.6
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-207ENST00000561732 643 ntTSL 220.37■□□□□ 0.854e-47■■■■■ 577.6
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-208ENST00000562583 1933 ntTSL 1 (best)19.39■□□□□ 0.694e-47■■■■■ 577.6
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-212ENST00000564035 786 ntTSL 217.63■□□□□ 0.414e-47■■■■■ 577.6
UTP3Q9NQZ2 SPCS3-203ENST00000507678 2655 ntTSL 224.06■■□□□ 1.443e-13■■■■■ 574.5
UTP3Q9NQZ2 SPCS3-204ENST00000513139 589 ntTSL 214.72□□□□□ -0.053e-13■■■■■ 574.5
UTP3Q9NQZ2 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.073e-13■■■■■ 574.5
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.154e-7■■■■■ 574
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-219ENST00000530316 573 ntTSL 420.92■□□□□ 0.944e-7■■■■■ 574
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-224ENST00000533245 589 ntTSL 520.92■□□□□ 0.944e-7■■■■■ 574
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-207ENST00000526125 554 ntTSL 520.92■□□□□ 0.944e-7■■■■■ 574
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-213ENST00000529494 560 ntTSL 420.75■□□□□ 0.914e-7■■■■■ 574
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-210ENST00000528187 648 ntTSL 518.11■□□□□ 0.494e-7■■■■■ 574
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 574
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-221ENST00000532795 587 ntTSL 415.34■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 574
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-223ENST00000533235 581 ntTSL 515.34■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 574
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-222ENST00000533051 571 ntTSL 215.19■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 574
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-204ENST00000524863 539 ntTSL 314.43□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 574
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