Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PFDN4Q9NQP4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN4Q9NQP4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFDN4Q9NQP4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms