Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRC4Q9NPP4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRC4Q9NPP4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRC4Q9NPP4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NLRC4Q9NPP4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms