Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRCC1Q9NPI7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRCC1Q9NPI7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRCC1Q9NPI7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRCC1Q9NPI7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRCC1Q9NPI7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms