Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD90

NEUROD4, Neurogenic differentiation factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD4Q9HD90 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD4Q9HD90 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD4Q9HD90 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD4Q9HD90 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD4Q9HD90 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD4Q9HD90 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEUROD4Q9HD90 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD4Q9HD90 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEUROD4Q9HD90 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD4Q9HD90 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD4Q9HD90 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD4Q9HD90 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD4Q9HD90 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD4Q9HD90 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms