Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S5

FKRP, Fukutin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKRPQ9H9S5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FKRPQ9H9S5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FKRPQ9H9S5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FKRPQ9H9S5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms