Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C10orf88Q9H8K7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C10orf88Q9H8K7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C10orf88Q9H8K7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C10orf88Q9H8K7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C10orf88Q9H8K7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C10orf88Q9H8K7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C10orf88Q9H8K7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C10orf88Q9H8K7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C10orf88Q9H8K7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
C10orf88Q9H8K7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
C10orf88Q9H8K7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C10orf88Q9H8K7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C10orf88Q9H8K7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C10orf88Q9H8K7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C10orf88Q9H8K7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C10orf88Q9H8K7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C10orf88Q9H8K7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C10orf88Q9H8K7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C10orf88Q9H8K7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
C10orf88Q9H8K7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms