Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M9

EHD1, EH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1Q9H4M9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EHD1Q9H4M9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD1Q9H4M9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EHD1Q9H4M9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD1Q9H4M9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD1Q9H4M9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD1Q9H4M9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EHD1Q9H4M9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD1Q9H4M9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD1Q9H4M9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD1Q9H4M9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD1Q9H4M9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD1Q9H4M9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD1Q9H4M9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD1Q9H4M9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EHD1Q9H4M9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD1Q9H4M9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD1Q9H4M9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD1Q9H4M9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EHD1Q9H4M9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EHD1Q9H4M9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EHD1Q9H4M9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms