Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Z9

RBM38, RNA-binding protein 38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM38Q9H0Z9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBM38Q9H0Z9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM38Q9H0Z9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM38Q9H0Z9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM38Q9H0Z9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM38Q9H0Z9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM38Q9H0Z9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM38Q9H0Z9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM38Q9H0Z9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM38Q9H0Z9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM38Q9H0Z9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM38Q9H0Z9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM38Q9H0Z9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM38Q9H0Z9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM38Q9H0Z9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM38Q9H0Z9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM38Q9H0Z9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM38Q9H0Z9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM38Q9H0Z9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM38Q9H0Z9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM38Q9H0Z9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM38Q9H0Z9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RBM38Q9H0Z9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM38Q9H0Z9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM38Q9H0Z9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM38Q9H0Z9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM38Q9H0Z9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM38Q9H0Z9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM38Q9H0Z9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM38Q9H0Z9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM38Q9H0Z9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM38Q9H0Z9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM38Q9H0Z9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM38Q9H0Z9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM38Q9H0Z9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM38Q9H0Z9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM38Q9H0Z9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM38Q9H0Z9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM38Q9H0Z9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM38Q9H0Z9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms