Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM2Q9C040 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM2Q9C040 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM2Q9C040 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM2Q9C040 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms