Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PUS3Q9BZE2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PUS3Q9BZE2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PUS3Q9BZE2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PUS3Q9BZE2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
PUS3Q9BZE2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PUS3Q9BZE2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PUS3Q9BZE2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PUS3Q9BZE2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PUS3Q9BZE2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PUS3Q9BZE2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PUS3Q9BZE2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PUS3Q9BZE2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PUS3Q9BZE2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PUS3Q9BZE2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PUS3Q9BZE2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PUS3Q9BZE2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PUS3Q9BZE2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PUS3Q9BZE2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PUS3Q9BZE2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PUS3Q9BZE2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PUS3Q9BZE2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PUS3Q9BZE2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PUS3Q9BZE2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PUS3Q9BZE2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PUS3Q9BZE2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PUS3Q9BZE2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PUS3Q9BZE2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PUS3Q9BZE2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PUS3Q9BZE2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PUS3Q9BZE2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PUS3Q9BZE2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PUS3Q9BZE2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PUS3Q9BZE2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PUS3Q9BZE2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PUS3Q9BZE2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PUS3Q9BZE2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PUS3Q9BZE2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PUS3Q9BZE2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PUS3Q9BZE2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PUS3Q9BZE2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PUS3Q9BZE2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PUS3Q9BZE2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PUS3Q9BZE2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PUS3Q9BZE2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PUS3Q9BZE2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PUS3Q9BZE2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PUS3Q9BZE2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PUS3Q9BZE2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PUS3Q9BZE2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PUS3Q9BZE2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PUS3Q9BZE2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms