Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PITPNM3Q9BZ71 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PITPNM3Q9BZ71 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PITPNM3Q9BZ71 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PITPNM3Q9BZ71 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms