Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms