Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LIMD2Q9BT23 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LIMD2Q9BT23 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LIMD2Q9BT23 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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