Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
AGMATQ9BSE5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AGMATQ9BSE5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AGMATQ9BSE5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AGMATQ9BSE5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AGMATQ9BSE5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AGMATQ9BSE5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
AGMATQ9BSE5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AGMATQ9BSE5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AGMATQ9BSE5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AGMATQ9BSE5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms