Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR61

ACBD6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD6Q9BR61 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACBD6Q9BR61 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACBD6Q9BR61 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACBD6Q9BR61 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACBD6Q9BR61 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACBD6Q9BR61 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACBD6Q9BR61 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACBD6Q9BR61 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACBD6Q9BR61 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACBD6Q9BR61 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ACBD6Q9BR61 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACBD6Q9BR61 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACBD6Q9BR61 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACBD6Q9BR61 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACBD6Q9BR61 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACBD6Q9BR61 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACBD6Q9BR61 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ACBD6Q9BR61 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ACBD6Q9BR61 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACBD6Q9BR61 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms