Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USB1Q9BQ65 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USB1Q9BQ65 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USB1Q9BQ65 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USB1Q9BQ65 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms