Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ELF4Q99607 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ELF4Q99607 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELF4Q99607 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ELF4Q99607 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELF4Q99607 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELF4Q99607 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELF4Q99607 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ELF4Q99607 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELF4Q99607 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELF4Q99607 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELF4Q99607 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELF4Q99607 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELF4Q99607 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELF4Q99607 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ELF4Q99607 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELF4Q99607 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELF4Q99607 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ELF4Q99607 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELF4Q99607 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ELF4Q99607 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ELF4Q99607 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ELF4Q99607 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ELF4Q99607 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ELF4Q99607 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ELF4Q99607 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ELF4Q99607 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ELF4Q99607 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ELF4Q99607 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ELF4Q99607 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ELF4Q99607 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ELF4Q99607 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELF4Q99607 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms