Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PCNX1Q96RV3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNX1Q96RV3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNX1Q96RV3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNX1Q96RV3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCNX1Q96RV3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCNX1Q96RV3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCNX1Q96RV3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNX1Q96RV3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNX1Q96RV3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNX1Q96RV3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNX1Q96RV3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNX1Q96RV3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCNX1Q96RV3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNX1Q96RV3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNX1Q96RV3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNX1Q96RV3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCNX1Q96RV3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNX1Q96RV3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNX1Q96RV3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCNX1Q96RV3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCNX1Q96RV3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNX1Q96RV3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNX1Q96RV3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNX1Q96RV3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNX1Q96RV3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX1Q96RV3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms