Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ1

SIGLEC12, Sialic acid-binding Ig-like lectin 12, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGLEC12Q96PQ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIGLEC12Q96PQ1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIGLEC12Q96PQ1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIGLEC12Q96PQ1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIGLEC12Q96PQ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIGLEC12Q96PQ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIGLEC12Q96PQ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIGLEC12Q96PQ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIGLEC12Q96PQ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIGLEC12Q96PQ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIGLEC12Q96PQ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIGLEC12Q96PQ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIGLEC12Q96PQ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIGLEC12Q96PQ1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIGLEC12Q96PQ1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIGLEC12Q96PQ1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIGLEC12Q96PQ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIGLEC12Q96PQ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIGLEC12Q96PQ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIGLEC12Q96PQ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIGLEC12Q96PQ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIGLEC12Q96PQ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIGLEC12Q96PQ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms