Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT5

SLC46A1, Proton-coupled folate transporter, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A1Q96NT5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC46A1Q96NT5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC46A1Q96NT5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC46A1Q96NT5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC46A1Q96NT5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC46A1Q96NT5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC46A1Q96NT5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC46A1Q96NT5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC46A1Q96NT5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC46A1Q96NT5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC46A1Q96NT5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC46A1Q96NT5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC46A1Q96NT5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC46A1Q96NT5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC46A1Q96NT5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC46A1Q96NT5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC46A1Q96NT5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC46A1Q96NT5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC46A1Q96NT5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC46A1Q96NT5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC46A1Q96NT5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC46A1Q96NT5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC46A1Q96NT5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC46A1Q96NT5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC46A1Q96NT5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC46A1Q96NT5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC46A1Q96NT5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC46A1Q96NT5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC46A1Q96NT5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC46A1Q96NT5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC46A1Q96NT5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC46A1Q96NT5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC46A1Q96NT5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC46A1Q96NT5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC46A1Q96NT5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC46A1Q96NT5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC46A1Q96NT5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC46A1Q96NT5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC46A1Q96NT5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC46A1Q96NT5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC46A1Q96NT5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC46A1Q96NT5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC46A1Q96NT5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC46A1Q96NT5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC46A1Q96NT5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC46A1Q96NT5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC46A1Q96NT5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC46A1Q96NT5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC46A1Q96NT5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC46A1Q96NT5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC46A1Q96NT5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC46A1Q96NT5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A1Q96NT5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms