Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDH12Q96NR8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDH12Q96NR8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RDH12Q96NR8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RDH12Q96NR8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RDH12Q96NR8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RDH12Q96NR8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RDH12Q96NR8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH12Q96NR8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH12Q96NR8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH12Q96NR8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH12Q96NR8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH12Q96NR8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH12Q96NR8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH12Q96NR8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms