Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFXN2Q96NB2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFXN2Q96NB2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFXN2Q96NB2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFXN2Q96NB2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms