Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCMTD1Q96MG8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PCMTD1Q96MG8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCMTD1Q96MG8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PCMTD1Q96MG8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCMTD1Q96MG8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms