Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC114Q96M63 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC114Q96M63 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC114Q96M63 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC114Q96M63 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC114Q96M63 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC114Q96M63 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC114Q96M63 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC114Q96M63 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC114Q96M63 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC114Q96M63 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC114Q96M63 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC114Q96M63 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC114Q96M63 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC114Q96M63 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC114Q96M63 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC114Q96M63 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC114Q96M63 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC114Q96M63 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC114Q96M63 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC114Q96M63 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC114Q96M63 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC114Q96M63 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC114Q96M63 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC114Q96M63 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC114Q96M63 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC114Q96M63 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC114Q96M63 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC114Q96M63 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC114Q96M63 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC114Q96M63 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC114Q96M63 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC114Q96M63 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC114Q96M63 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC114Q96M63 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC114Q96M63 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC114Q96M63 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC114Q96M63 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC114Q96M63 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC114Q96M63 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC114Q96M63 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC114Q96M63 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC114Q96M63 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC114Q96M63 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC114Q96M63 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms