Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPNQ96H22 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPNQ96H22 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPNQ96H22 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPNQ96H22 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPNQ96H22 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPNQ96H22 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPNQ96H22 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPNQ96H22 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPNQ96H22 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPNQ96H22 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPNQ96H22 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPNQ96H22 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPNQ96H22 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPNQ96H22 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPNQ96H22 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPNQ96H22 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPNQ96H22 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPNQ96H22 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPNQ96H22 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPNQ96H22 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPNQ96H22 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPNQ96H22 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPNQ96H22 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPNQ96H22 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPNQ96H22 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPNQ96H22 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CENPNQ96H22 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPNQ96H22 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms