Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRMT2BQ96GJ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRMT2BQ96GJ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRMT2BQ96GJ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRMT2BQ96GJ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRMT2BQ96GJ1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms