Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUB1Q96FW1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OTUB1Q96FW1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTUB1Q96FW1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUB1Q96FW1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms