Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPDL1Q96EA4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPDL1Q96EA4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDL1Q96EA4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPDL1Q96EA4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPDL1Q96EA4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPDL1Q96EA4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPDL1Q96EA4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPDL1Q96EA4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPDL1Q96EA4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPDL1Q96EA4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPDL1Q96EA4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPDL1Q96EA4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDL1Q96EA4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDL1Q96EA4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDL1Q96EA4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDL1Q96EA4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDL1Q96EA4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPDL1Q96EA4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPDL1Q96EA4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPDL1Q96EA4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPDL1Q96EA4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPDL1Q96EA4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms