Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP4Q96DX8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTP4Q96DX8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTP4Q96DX8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTP4Q96DX8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RTP4Q96DX8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTP4Q96DX8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RTP4Q96DX8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP4Q96DX8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP4Q96DX8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP4Q96DX8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP4Q96DX8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTP4Q96DX8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTP4Q96DX8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP4Q96DX8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP4Q96DX8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP4Q96DX8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP4Q96DX8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP4Q96DX8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP4Q96DX8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP4Q96DX8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP4Q96DX8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP4Q96DX8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms