Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NMD3Q96D46 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NMD3Q96D46 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NMD3Q96D46 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NMD3Q96D46 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NMD3Q96D46 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms