Protein–RNA interactions for Protein: Q92769

HDAC2, Histone deacetylase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2Q92769 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC2Q92769 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC2Q92769 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC2Q92769 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC2Q92769 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms