Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RORBQ92753 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RORBQ92753 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RORBQ92753 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RORBQ92753 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RORBQ92753 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RORBQ92753 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RORBQ92753 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RORBQ92753 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RORBQ92753 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RORBQ92753 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RORBQ92753 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RORBQ92753 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RORBQ92753 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RORBQ92753 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RORBQ92753 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RORBQ92753 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RORBQ92753 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RORBQ92753 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RORBQ92753 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RORBQ92753 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RORBQ92753 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RORBQ92753 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RORBQ92753 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RORBQ92753 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RORBQ92753 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RORBQ92753 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RORBQ92753 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RORBQ92753 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RORBQ92753 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RORBQ92753 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RORBQ92753 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RORBQ92753 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RORBQ92753 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RORBQ92753 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RORBQ92753 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RORBQ92753 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RORBQ92753 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RORBQ92753 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RORBQ92753 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RORBQ92753 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RORBQ92753 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RORBQ92753 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RORBQ92753 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RORBQ92753 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RORBQ92753 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RORBQ92753 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RORBQ92753 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RORBQ92753 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RORBQ92753 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RORBQ92753 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RORBQ92753 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RORBQ92753 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RORBQ92753 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RORBQ92753 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RORBQ92753 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RORBQ92753 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RORBQ92753 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RORBQ92753 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RORBQ92753 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RORBQ92753 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RORBQ92753 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RORBQ92753 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RORBQ92753 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RORBQ92753 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RORBQ92753 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RORBQ92753 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RORBQ92753 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RORBQ92753 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RORBQ92753 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RORBQ92753 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RORBQ92753 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RORBQ92753 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RORBQ92753 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RORBQ92753 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RORBQ92753 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RORBQ92753 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RORBQ92753 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RORBQ92753 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RORBQ92753 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RORBQ92753 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RORBQ92753 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RORBQ92753 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RORBQ92753 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RORBQ92753 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RORBQ92753 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RORBQ92753 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RORBQ92753 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RORBQ92753 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RORBQ92753 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RORBQ92753 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RORBQ92753 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RORBQ92753 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RORBQ92753 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RORBQ92753 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RORBQ92753 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RORBQ92753 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RORBQ92753 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RORBQ92753 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RORBQ92753 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms