Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC107Q8WV48 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC107Q8WV48 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC107Q8WV48 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC107Q8WV48 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms