Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF47

ZFP90, Zinc finger protein 90 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP90Q8TF47 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFP90Q8TF47 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFP90Q8TF47 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZFP90Q8TF47 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZFP90Q8TF47 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms