Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF3IP1Q8TDR0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF3IP1Q8TDR0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF3IP1Q8TDR0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF3IP1Q8TDR0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF3IP1Q8TDR0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAF3IP1Q8TDR0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAF3IP1Q8TDR0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms