Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RP9Q8TA86 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RP9Q8TA86 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RP9Q8TA86 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RP9Q8TA86 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RP9Q8TA86 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RP9Q8TA86 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RP9Q8TA86 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RP9Q8TA86 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RP9Q8TA86 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RP9Q8TA86 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RP9Q8TA86 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RP9Q8TA86 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RP9Q8TA86 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RP9Q8TA86 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RP9Q8TA86 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RP9Q8TA86 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RP9Q8TA86 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RP9Q8TA86 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RP9Q8TA86 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms