Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEZ2

VPS37A, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37AQ8NEZ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37AQ8NEZ2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37AQ8NEZ2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS37AQ8NEZ2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37AQ8NEZ2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms