Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNAAF3Q8N9W5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF3Q8N9W5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNAAF3Q8N9W5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF3Q8N9W5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF3Q8N9W5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNAAF3Q8N9W5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNAAF3Q8N9W5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNAAF3Q8N9W5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNAAF3Q8N9W5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DNAAF3Q8N9W5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF3Q8N9W5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF3Q8N9W5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF3Q8N9W5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF3Q8N9W5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF3Q8N9W5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF3Q8N9W5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF3Q8N9W5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DNAAF3Q8N9W5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNAAF3Q8N9W5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms